殿内
此庙为北桃园的妈祖信仰中心，其妈祖称为“桃园妈”[5][6]。在妈祖圣诞会绕境芦竹、龟山和八德外境、桃园区[6]。陪祀观世音菩萨、注生娘娘、文昌帝君、月老神君、道姥元君、地藏王菩萨、武财神、六十甲子太岁星君、福德正神等[7]。庙附近有不少特种营业场所，庙方说有酒店小姐可能想获得好归宿，在给月老的祈愿卡上写着要赶走他人的妻子[8]。
中路的炉主，在农历正月初五会依日治时期就有的习俗，邀此庙、桃园景福宫、莲华寺等桃园地区七大庙宇的神明，至中路派出所旁的集会所看戏。当日会以妈祖为主位，其他神明在侧。下午平安戏、相关祈福法会结束后，炉主就会送神明回去。[9]
因与苑里慈护宫、金包里慈护宫同名，三庙缔结为姊妹庙[1]。像是1986年桃园慈护宫举行丙寅年五朝护国祈安大法会，游行至竹围海水浴场，有金包里慈护宫信徒数百人参与，以桃园县长徐鸿志担任领队[10]。次年，桃园地区妈祖信徒，为纪念妈祖成道一千年，由桃园慈护宫和中坜仁海宫共同主办游行，分别负责北桃园与南桃园[11]。
1988年4月30日（农历三月十五）起到5月6日（三月廿一），慈护宫建醮，在慈护宫庙前、阳明社区空地，桃园高中女生部后侧、市立棒球场及大湳，各搭建一座醮坛，全桃园市斋戒，并须禁屠、禁曝（露天曝晒内裤）、禁用（用苎麻捆缚六畜、用丧家用过布类缝成的粿袋）。[12]